Плохая совместимость растений чаще всего объясняется их корневыми или листовыми выделениями, которые могут тормозить развитие соседних культур. Обычно эти выделения угнетают какой-нибудь один или два вида, а другим не мешают. Например, анис не уживается с морковью, иссоп — с редисом, бархатцы плохо воздействуют на бобы.
Однако есть растения, которые выделяют вещества, плохо переносимые большинством соседей. В частности, к неуживчивым относится фенхель. Сильное отрицательное действие на культурные растения оказывают пырей ползучий, марь белая, щавель конский. Выделения пырея особенно сильно угнетают кукурузу.
Установлено, что при выращивании на одной грядке в соседних рядах отрицательно влияют друг на друга шнитт-лук и бобовые, лук и капуста. Но если выращивать эти растения на рядом расположенных грядках, то эти же самые комбинации дают положительный результат. Очевидно, при рядковом посеве мешают корневые выделения. Плохими соседями являются лук — для бобов, гороха и шалфея, укроп — для моркови и томатов, чеснок — для бобовых и капусты.