Корневище и корни хрена исключительно живучи, морозостойки, проникают на глубину до 2 м, но основная их часть находится не ниже 40 см.
Хрен особенно сильно разрастается гам, где участок после уборки урожая не перекапывают. Чтобы избавиться от агрессивного растения, осенью необходимо провести глубокое послойное перекапывание на два штыка лопаты и при этом тщательно выбрать корневища хрена. Весной, при появлении изреженных растений, проводят вторичное перекапывание, но уже на штык лопаты. 2-3 перекопок будет достаточно.
Еще один вариант — осенью в послеуборочный период опрыснуть растения по листьям гербицидом «Раундап». На следующий год этот участок можно использовать под посев или посадку других растений.